Директорат за поморску и унутрашњу пловидбу

Задужен за сигурност и безбједност пловидбе, заштиту од загађења, те очување људских живота и морског окружења. Надгледа примјену националних и међународних прописа и развија стратегије и управља инфраструктурним пројектима у области поморског саобраћаја. Такође, пружа подршку лучким капетанијама, обавља инспекцијске и управне послове и сарађује са међународним организацијама и институцијама.